区

        大溪：牡丹乡

        四重溪：车城乡

        曾文溪：七区、安南区

        安朔溪：达仁乡、大武乡

        东港溪：新园乡、东港镇

        竹坑溪：枋山乡、车城乡

        刣牛溪：恆春镇

        鱼寮溪：大城乡

        大石盘溪（石盘溪）：枋山乡

        无水溪：满州乡

        鹿寮溪：满州乡

        清水溪

        大竹溪：大武乡、太麻里乡

        拉布拉溪：太麻里乡

        旧浊水溪：福兴乡

        嘉义县

        卡社溪

        乌溪：台中市龙井区、彰化县伸港乡

        前镇河：前镇区

        枋山溪：枋山乡

        鹿野溪

        爱河：鼓山区、苓雅区

        朝庸溪：大武乡

        隘寮溪

        南仁鬱溪：满州乡

        后堀溪

        浊水溪：大城乡、云林县麦寮乡

        太麻里溪：太麻里乡

        洋子溪（洋仔厝溪）：鹿港镇

        加走寮溪

        乌万溪（大鸟溪）：大武乡

        达仁溪：达仁乡

        眉溪

        石牛溪：恆春镇

        云林县

        员林大排：鹿港镇、福兴乡

        乌溪：龙井区、彰化县伸港乡

        前溪

        港子溪：满州乡

        旭海溪：牡丹乡

        二仁溪：南区、高雄市茄萣区

        水里溪

        牛挑湾溪：口湖乡

        汉宝溪：福兴乡、芳苑乡

        塔瓦溪：屏东县牡丹乡、台东县达仁乡

        知本溪：太麻里乡、台东市

        溪仔口溪：满州乡

        利嘉溪：台东市

        新虎尾溪：麦寮乡、台西乡

        鹿耳门溪：安南区

        北港溪：云林县口湖乡、嘉义县东石乡

        枫港溪：枋山乡

        九棚溪：满州乡

        高屏溪：高雄市林园区、屏东县新园乡

        万大溪

        安良港大排（南势溪）：清水区

        阿公店溪：永安区、弥陀区

        港口溪：满州乡

        埤日溪：满州乡

        二仁溪：台南市南区、高雄市茄萣区

        陈有兰溪

        急水溪：北门区

        万丈深坑溪：满州乡

        太平溪：台东市

        社皆坑溪：车城乡

        白水溪

        朴子溪：东石乡

        荖溪

        乾溪：牡丹乡

        合欢溪

        狮子溪：枋山乡

        盐水溪：安南区、安平区

        南势湖溪：枋山乡

        三叠溪

        屏东县

        浊口溪

        美溪

        后劲溪：楠梓区

        志乐溪

        七里溪：枋山乡

        率芒溪（士文溪）：枋寮乡、枋山乡

        高雄市

        旗山溪

        清水大排水沟（米粉寮溪）：清水区

        龙溪：布袋镇

        彰化县

        猫罗溪

        大武溪：大武乡

        拉库音溪

        十里溪：枋寮乡（地图未标示）

        高屏溪：林园区、屏东县新园乡

        丹大溪

        台南市

        北港溪：口湖乡、嘉义县东石乡

        八掌溪：嘉义县布袋镇、台南市北门区

        金崙溪：太麻里乡

        南港溪

        塔瓦溪：牡丹乡、台东县达仁乡

        台东县

        南兴溪：大武乡

        重溪

        菜寮溪

        社口溪

        后港溪：芳苑乡

        郡大溪

        卑南溪：台东市

        将军溪：北门区、将军区

        七溪：七区

        八掌溪：布袋镇、台南市北门区

        二林溪：芳苑乡

        保力溪：车城乡

        林边溪：林边乡、佳冬乡

        大湖口溪

        内寮溪：枋寮乡

        津林溪（加津林溪）：大武乡

        文里溪（北太麻里溪）：太麻里乡

        典宝溪：梓官区、楠梓区

        宝来溪

        南湖溪

        浊水溪：彰化县大城乡、云林县麦寮乡

        旧虎尾溪：台西乡、四湖乡

        番雅沟：线西乡、鹿港镇